دوره کامل کارآموزی بیوانفورماتیک ساختاری شامل:

دوره اول – مقدمات بیوانفورماتیک

دوره دوم – ابزارهای پیشرفته

دوره سوم – انجام پروژه

فقط با پرداخت هزینه دو دوره، در هر سه دوره شرکت کنید.

 

سرفصل‌های دوره کامل کارآموزی بیوانفورماتیک ساختاری

دوره اول کارآموزی – مقدمات بیوانفورماتیک ساختاری

  • جستجو در پایگاه های اطلاعات علمی
  • مقدمه‌ای بر بیوانفورماتیک
  • ساختار پروتئین‌ها
  • نحوه اتصال به سرورهای لینوکسی، تبادل فایل با سرور و فرامین پرکاربرد لینوکس
  • آشنایی و کار با پایگاه داده‌های زیستی و سایت‌های بیوانفورماتیک
    • NCBI
    • PDB
    • UniProt
  • آشنایی و کار با نرم‌افزارهای پایه
    •  Yasara
    • Swiss PDB Viewer
    • Chimera
    • Hyperchem

 

دوره دوم کارآموزی – ابزارهای پیشرفته در بیوانفورماتیک

  • مدلسازی ساختار پروتئین ها
    • ابزارهای مدلسازی تحت وب
    • آموزش نرم افزار مدلر (پایه و پیشرفته)
  • داکینگ پروتئین – پروتئین
    • HADDOCKدوره کامل کارآموزی بیوانفورماتیک ساختاری شامل:

      دوره اول – مقدمات بیوانفورماتیک

      دوره دوم – ابزارهای پیشرفته

      دوره سوم – انجام پروژه

    • ClusPro
  • داکینگ پروتئین لیگاند و غربالگری مجازی
    • آشنایی با پایگاه داده های ترکیبات شیمیایی
    • MGLTools
    • Autodock
    • Vina Dock
    • Ligplus
    • Raccoon
  • شبیه‌سازی دینامیک مولکولی
    • شبیه سازی سازه های پروتئينی
    • شبیه سازی پروتئین و لیگاند
  • نرم افزارهای کمکی جهت طراحی و مهندسی پروتئین (Osprey, HSSP, CFinder, …)

 

دوره سوم کارآموزی – پروژه عملی

  • پیشنهاد پروژه از طرف شرکت کننده
  • ارزیابی پروژه و امکان پذیری آن از طرف مجموعه انجام خواهد شد
  • بکارگیری ابزارهای تخصصی برای انجام پروژه اختصاصی تایید شده توسط فرد و با پشتیبانی منتورها
  • آنالیز نتایج
  • نگارش گزارش در قالب مقاله

شروع دوره: متعاقباً اعلام می گردد