چنانچه در پروژه ای نیاز داشته باشید که محل اتصال یک ترکیب شیمیایی با یک پروتئین بصورت محاسباتی سنجیده شود از ابزارهای داکینگ پروتئین – لیگاند باید بهره ببرید.
طی دو دهه گذشته، بیش از 60 ابزار و برنامه مختلف در این زمینه تولید شده اند که برخی برای جامعه آکادمیک رایگان و برخی نیز فقط نسخه تجاری دارند از این جمله میتوان به DOCK، AutoDock، FlexX، Surflex، GOLD ، ICM ، Glide ، Cdocker ، LigandFit ، MCDock ، FRED ، MOE-Dock ، LeDock ، AutoDock Vina ، rDock ، UCSF Dock و بسیاری دیگراشاره نمود .
بسیار مهم: توجه داشته باشید برای استفاده از این نرم افزارها چنانچه لایسنس معتبر نرم افزار مورد نظر را ندارید حتما از نرم افزارهایی که برای جامعه آکادمیک رایگان هستند استفاده کنید. چاپ مقالاتی که در آنها از نرم افزارهای تجاری استفاده غیر مجاز شده باشد، میتواند به اعتبار علمی شما لطمه وارد کند.
