فعالیت آنزیم تحت تاثیر عوامل مختلفی همچون دما، pH، غلظت و … می‌تواند باشد.
آنزیم‌ها در شرایط خاص دمایی و pH بهترین عملکرد را دارند و شرایط غیربهینه باعث می‌شود که آنزیم توانایی اتصال به یک سوبسترا را از دست بدهد.
در خیلی از موارد علاقه‌مند هستیم که میزان فعالیت آنزیم مورد نظر خود را در شرایط بهینه آن از نظر دما و pH افزایش دهیم.
افزایش فعالیت آنزیم در مقایسه با افزایش پایداری آن بسیار حساس‌تر است و در صورت جهش نادرست ممکن است فعالیت آنزیم نیز از دست برود. برای افزایش فعالیت آنزیم به ساختار سه بعدی آنزیم و مکانیسم عمل آن نیاز می‌باشد.
